L10
طاقة الارتباط الحرة
MM/PBSA وFEP وTI والمعاينة المعززة — الدقة مقابل التكلفة.
من ΔG إلى الطريقة
ما الذي تقيسه كل طريقة.
ΔG الارتباط
ΔH − TΔS وما الذي يُقاس فعلاً.
22 دقيقة
MM/PBSA وMM/GBSA
المكوّنات: MM، إذابة قطبية وغير قطبية، إنتروبي.
32 دقيقة
تفكيك الطاقة لكل بقايا
مؤشر تصميم لا برهان سببي.
20 دقيقة
حدود MM/PBSA
متى تكون الطريقة غير ملائمة.
24 دقيقة
FEP وTI
تحولات كيميائية في خريطة ترموديناميكية.
30 دقيقة
Umbrella وMetadynamics وABF
معاينة الأحداث النادرة.
26 دقيقة
اختيار طريقة الطاقة الحرة
دقة، تكلفة، سؤال علمي.
18 دقيقة