L6 · 28 دقيقة
طرائق الشحن
Mulliken وRESP وAM1-BCC.
الميكانيكا الجزيئيةالكيمياء الكمومية
أهداف التعلّم
- التفريق بين Mulliken وRESP وAM1-BCC ومتى تُستخدم كلٌ في إعداد ligand.
- رفض Mulliken كشحنات ديناميكا دون وعي حدودها.
تقسيم الكثافة اصطلاح
Mulliken يوزّع سكاناً حسب تداخل أساس؛ حسّاس للأساس وقد يُعطي قيماً غير مستقرة. RESP يُلائم الجهد الكهروستاتيكي حول الجزيء مع قيود، وهو شائع مع AMBER/GAFF. AM1-BCC رخيص يُقارب جودة ملائمة الجهد في كثير من ligands العضوية الصغيرة. لا معنى لشحنة «أصح» خارج اتساق الحقل.
| RESP | AM1-BCC | |
|---|---|---|
| التكلفة | يحتاج حساب QM (غالباً HF/6-31G* في البروتوكول الكلاسيكي). | شبه تجريبي سريع لمكتبات أكبر. |
| الاستخدام | ligand نهائي أو سلسلة قصيرة مع AMBER. | تحضير واسع قبل الفرز أو MD استكشافي. |
| متى لا | على مليون مركب كخط أنابيب أعمى. | عندما تفشل الكيمياء شبه التجريبية (معادن، بعض الهيتيروسيكلات القاسية) دون فحص. |
لماذا؟ — لماذا يُحذر من Mulliken في MD؟
القيم تتقلب مع الأساس وقد لا تُعيد إنتاج الجهد خارج الجزيء، وهو ما يحتاجه coulomb بين ligand والجيب. RESP يستهدف ذلك الجهد. Mulliken قد يبقى تشخيصاً تعليمياً لا مصدراً لشحنات إنتاج.
ماذا لو؟ — ماذا لو حسبتَ RESP على هيئة واحدة ثم استخدمت الشحنات لمسار يزور هيئات بعيدة؟
الشحنة الثابتة لا تتبع الكثافة. في ligands شديدة الاستقطاب قد تحتاج متوسط هيئات أو حقلاً قابلاً للاستقطاب. على الأقل اختبر حساسية الشحنة لهيئتين.
مواضيع مرتبطة