L4
بنية البروتين
من الحمض الأميني إلى الجيب، ومن البلورة إلى ملف PDB.
قراءة البنية
ما الذي تراه العين الخبيرة في PDB.
الأحماض الأمينية في الجيب
من الجانب السلسلة إلى التفاعل.
22 دقيقة
تسلسل البنية
أولي إلى رباعي.
20 دقيقة
حلزون وصحيفة وعروة
العُرى غالباً مكان الارتباط.
20 دقيقة
الجيوب والمواقع التفارغية
حفرة تقويمية ليست الموقع الوحيد.
26 دقيقة
تحديد البنية: أشعة سينية، cryo-EM، NMR
كل طريقة تُشوّه الحقيقة بطريقة مختلفة.
28 دقيقة
الدقة وB-factor والإشغال
كيف تقرأ جودة البلورة قبل أن ترسّم.
30 دقيقة
فحص ملف PDB بعمق
رواسب ناقصة، هيئات بديلة، روابط غير قياسية.
28 دقيقة
الماء والمعادن والعوامل المرافقة
حذفها قد يحذف الفيزياء.
26 دقيقة